Emir Timur dünyasını değiştiği gibi, dedesinin yanında olan Sultan Halil bazı emirlerin yardımıyla hâkimiyeti ele aldı, hâlbuki Timur varis olarak Pir Muhammed'in adını vermişti. O ise çok uzakta, Hindistan'da idi, istese de gelip yetişemezdi. Birkaç emir bilirdi ki, Pir Muhammed saltanata sahip olsa, onlar saraydan uzaklaştırılacaklardı... Yerlerini korumak için Sultan Halil'in hâkimiyetini tanıdılar ve ona destek oldular... Lakin çok geçmedi ki, yeni hükümdarın sebatsızlığı, idare etmesinin zayıf olduğu ortaya çıktı. Hâkimiyette kalması için el attığı, dedesinin dünyanın her yerinden topladığı hazine çok çabuk boşaldı. Emir Timur'un hanımları emirlerle evlendirildi. Hazine boşaldıktan sonra yanındakiler bir bir ondan uzaklaşmaya başladılar. Neticede Sultan Halil devrildi ve Herat'a, amcası Şahruh'un yanına gitti... Lakin amcası onun bu ihanetini bağışlamadı. Sultan Halil ve hanımı zehirlenerek öldürüldü. Bundan sonra Şahruh askerlerini Semerkand'a gönderip isyancıları cezalandırdı ve oğlu Uluğ Bey'i Semerkand'a vali tayin ederek Herat'a döndü.
